Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3b2Q3UJB0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3b2Q3UJB0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms