Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx27Q3UHD6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx27Q3UHD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx27Q3UHD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms