Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Carmil3Q3UFQ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Carmil3Q3UFQ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Carmil3Q3UFQ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Carmil3Q3UFQ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms