Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nom1Q3UFM5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nom1Q3UFM5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nom1Q3UFM5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms