Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trafd1Q3UDK1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms