Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem109Q3UBX0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem109Q3UBX0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms