Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Q3U6N9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3U6N9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3U6N9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms