Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbc1d2bQ3U0J8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbc1d2bQ3U0J8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.6 ms