Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Ccdc136Q3TVA9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Ccdc136Q3TVA9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc136Q3TVA9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Ccdc136Q3TVA9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms