Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tamm41Q3TUH1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tamm41Q3TUH1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms