Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D17Wsu92eQ3TT38 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
D17Wsu92eQ3TT38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms