Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700066B19RikQ3TS39 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700066B19RikQ3TS39 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700066B19RikQ3TS39 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms