Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pnpla6Q3TRM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pnpla6Q3TRM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pnpla6Q3TRM4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms