Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrx1Q3TL44 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrx1Q3TL44 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrx1Q3TL44 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms