Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp4cQ3TKR3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4cQ3TKR3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms