Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RubcnlQ3TD16 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RubcnlQ3TD16 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnlQ3TD16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms