Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hs1bp3Q3TC93 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hs1bp3Q3TC93 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hs1bp3Q3TC93 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hs1bp3Q3TC93 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms