Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2-M3Q31093 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
H2-M3Q31093 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
H2-M3Q31093 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms