Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defb25Q30KN8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defb25Q30KN8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defb25Q30KN8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Defb25Q30KN8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defb25Q30KN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defb25Q30KN8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defb25Q30KN8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms