Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col24a1Q30D77 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col24a1Q30D77 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col24a1Q30D77 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col24a1Q30D77 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms