Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdgfl1Q2VPR5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms