Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psd3Q2PFD7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psd3Q2PFD7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psd3Q2PFD7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms