Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Spatc1Q148B6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Spatc1Q148B6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Spatc1Q148B6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Spatc1Q148B6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Spatc1Q148B6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Spatc1Q148B6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spatc1Q148B6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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