Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc39dQ0VF76 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc39dQ0VF76 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc39dQ0VF76 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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