Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col19a1Q0VF58 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col19a1Q0VF58 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col19a1Q0VF58 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms