Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hif3aQ0VBL6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hif3aQ0VBL6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hif3aQ0VBL6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms