Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cntnap5cQ0V8T7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap5cQ0V8T7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms