Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lrriq1Q0P5X1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Lrriq1Q0P5X1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Lrriq1Q0P5X1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms