Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata18Q0P557 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata18Q0P557 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spata18Q0P557 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata18Q0P557 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms