Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Neurl1bQ0MW30 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Neurl1bQ0MW30 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Neurl1bQ0MW30 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms