Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51Q08297 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51Q08297 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rad51Q08297 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms