Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tgm3Q08189 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tgm3Q08189 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms