Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atf4Q06507 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atf4Q06507 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atf4Q06507 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms