Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fmn1Q05860 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fmn1Q05860 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fmn1Q05860 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fmn1Q05860 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms