Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apoc2Q05020 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoc2Q05020 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms