Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox13Q04891 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sox13Q04891 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms