Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kcnb1Q03717 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Kcnb1Q03717 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnb1Q03717 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.9 ms