Protein–RNA interactions for Protein: Q03526

Itk, Tyrosine-protein kinase ITK/TSK, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItkQ03526 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ItkQ03526 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ItkQ03526 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItkQ03526 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItkQ03526 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItkQ03526 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms