Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl7Q03366 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl7Q03366 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl7Q03366 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms