Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Msx2Q03358 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Msx2Q03358 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms