Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk7Q03147 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdk7Q03147 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk7Q03147 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms