Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr4Q03142 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fgfr4Q03142 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr4Q03142 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms