Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Nhlh1Q02576 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlh1Q02576 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlh1Q02576 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms