Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snai1Q02085 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snai1Q02085 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms