Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ly9Q01965 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly9Q01965 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly9Q01965 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms