Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RykQ01887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RykQ01887 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RykQ01887 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RykQ01887 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RykQ01887 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RykQ01887 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RykQ01887 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RykQ01887 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RykQ01887 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RykQ01887 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RykQ01887 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RykQ01887 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RykQ01887 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RykQ01887 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RykQ01887 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RykQ01887 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms