Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd1Q01822 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd1Q01822 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms