Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cacna1cQ01815 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacna1cQ01815 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacna1cQ01815 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms