Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms