Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mc1rQ01727 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mc1rQ01727 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms